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日本産婦人科医会先天異常モニタリングの集計解析本部およびクリアリングハウス国際モニタリングセンター日本支部は1991年より神奈川県にある横浜市立大学医学部産婦人科におかれています。

実際にスタッフが常駐している場所は、横浜市立大学附属市民総合医療センターです。